微生物肥料是指通過發酵過程產生的單一或多種特定功能菌株，為植物提供有效養分或防治病蟲害的微生物菌劑。微生物肥料的核心是微生物，所以具有微生物的特性。微生物資源豐富，種類和功能多樣，可開發成不同功能和用途的肥料。而且，微生物菌株可以通過人工培養、純化和復壯來提高其活力，微生物肥料有很多種。目前微生物肥料產品一般分為兩類：一類是狹義的微生物肥料，是指通過微生物的活動增加植物養分的供給，包括土壤和生產環境中植物養分的總供給，從而改良植物營養狀況，提高產量。這類微生物肥料的代表品種是根瘤菌肥；另一種是廣義的微生物肥料，是指通過微生物的活動，能改良植物養分的供給，促進植物對養分的吸收利用或拮抗某些病原微生物的致病作用，減少作物病蟲害，促進作物增產

微生物肥料按微生物的種類可分為以下五類：(1)包括根瘤菌肥料、固氮菌肥、解磷菌肥和硅酸鹽菌肥；(2)放線菌肥料；(3)真菌肥料，包括外生菌根劑和內生菌根劑(4)藻類肥料，如固氮藍藻；(5)復合生物肥，即由幾種微生物混合而成的肥料。微生物肥料按其作用特點可分為以下兩大類：(1)微生物菌劑，即將有效微生物接種于作物根部，通過微生物的活動產生肥效或促進生長效果。這種類型以根瘤菌劑為代表；(2)復合微生物肥料，即由有益微生物與有機肥混合而成，其中含有用接種的有益微生物