菌肥生產中的載體很重要，關系到菌的“活性”。

當土壤中有足夠的有機質或腐殖質時，微生物可以更好地生存和繁殖并激活其他營養元素。土壤中的微生物菌主要產生各種酶，分解各種養分，產生各種酸和二氧化碳，為農作物提供更多的養分。為了微生物菌的生存和繁殖，土壤中須有足夠的有機質。所以我們提倡有機肥和菌肥搭配使用。

土壤有機質含量充足，土壤理化性狀良好，加強了土壤有益微生物的活動，從而促使有機質分解轉化，產生多種營養物質和刺激性物質。達到增產增收的目的。缺少有機質的土壤含水性差，各類肥液對作物根系的“表達”能力較差，導致根系生長內在刺激不足。

土壤有機質的缺乏會使化肥對土壤板結的影響強度更加突出。如果有機質豐富，化肥的利用率大大提高?；蕷埩粼谕寥乐械穆入x子、亞硝酸鹽等物質會轉化為水溶性有機化合物，以及豐富的土壤微生物的多重作用而無害化，使土地持續耕種。

因此，歸根結底，“土壤板結”的負面效應不是化學肥料的結果，而是忽視對土壤使用足量有機肥。

土壤中有機質缺乏，微生物所需碳源不足，導致根系微生物群落稀疏，根系生長的外源刺激太弱，根系失去生長的外界刺激。土壤板結和藥物危害(土壤中農藥殘留嚴重)，引起農作物各種病害。如果土壤富含有機質，這些危害可以減少甚至避免。

所以施用菌肥，請不要忘記補充土壤有機質。而補充土壤有機質簡單直接的方法是給土壤加有機肥。